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Resumo da oferta
The University of Udine in Italy is offering a 24-month postdoctoral research position within the Department of Medicine. The project focuses on elucidating the molecular mechanisms underlying the interaction between Oligomycin Sensitivity Conferral Protein (OSCP) and cyclophilin D. Selected candidates will conduct structural and dynamic studies using recombinant protein expression, NMR spectroscopy, Surface Plasmon Resonance, and atomistic molecular dynamics simulations. Key responsibilities include optimizing protein purification, preparing isotopically labeled samples for NMR, and analyzing binding kinetics and conformational changes. Applicants must hold a PhD and possess expertise in NMR applied to proteins, molecular dynamics simulations, and the expression of specifically labeled recombinant proteins. The role involves full-time engagement, supporting student laboratory activities, and contributing to scientific dissemination. Proficiency in English is required, along with adequate Italian knowledge for foreign candidates.
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Descrição do projeto
Articolo 1 Indizione della procedura di selezione È indetta una procedura di selezione pubblica, mediante valutazione comparativa, per titoli e colloquio, per il conferimento di n. 1 incarico post-doc, ai sensi dell’art. 22-bis della Legge n. 240 del 30.12.2010, sulla base delle seguenti specifiche: Codice concorso: 2026IPD50_02PHYS06_DMED Numero incarichi da attivare: 1 Direzione Risorse Umane e Affari Generali Ufficio Personale Accademico Responsabile della Direzione pro tempore: Gabriele Rizzetto Responsabile dell’Ufficio Personale Accademico: Silvia De Liddo Compilatore del procedimento: Michela Finelli
Documento informatico firmato digitalmente ai sensi del D.Igs. 82/2005 s.m.i. e norme collegate, il quale sostituisce il documento cartaceo e la firma autografa
Decreto Rettorale
Durata del contratto: 24 mesi Dipartimento: Dipartimento di Medicina Gruppo scientifico disciplinare: 02/PHYS-06 - Fisica per le scienze della vita, l'ambiente e i beni culturali, didattica e storia della fisica Settore scientifico disciplinare: PHYS-06/A - Fisica per le scienze della vita, l'ambiente e i beni culturali Progetto di ricerca oggetto del contratto e attività da svolgere: Titolo progetto: Meccanismi molecolari dell’interazione tra OSCP e ciclofillina D”, CUP G23C26001130005. Descrizione delle principali attività di ricerca su cui il titolare di incarico post-doc verrà impegnato: Il titolare dell’incarico post-doc sarà impegnato nello studio strutturale e della dinamica dell’interazione tra Oligomycin Sensitivity Conferral Protein (OSCP) e ciclofillina D. L’attività di ricerca comprenderà l’espressione ricombinante di OSCP e l’ottimizzazione delle relative condizioni di produzione. Il candidato si occuperà della messa a punto dei protocolli di espressione e purificazione mediante tecniche cromatografiche. Saranno effettuati controlli biochimici e biofisici per verificare purezza, stabilità e corretto ripiegamento della proteina. Particolare attenzione sarà dedicata alla preparazione di campioni isotopicamente marcati destinati agli studi NMR. L’interazione di OSCP con la ciclofillina D sarà caratterizzata mediante spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR) in soluzione. Gli esperimenti NMR consentiranno di identificare le regioni proteiche coinvolte nel riconoscimento molecolare. Saranno analizzate le perturbazioni di chemical shift indotte dalla formazione del complesso OSCP–ciclofillina D. Mediante titolazioni NMR saranno valutate l’affinità di legame, e le variazioni conformazionali associate. Il candidato confronterà il comportamento della ciclofillina D nelle forme completa e tronca in presenza di OSCP. Tale confronto permetterà di chiarire il contributo delle regioni terminali della ciclofillina D al riconoscimento di OSCP. Il binding tra OSCP e ciclofillina D sarà inoltre studiato mediante esperimenti di Surface Plasmon Resonance, SPR. Le analisi SPR consentiranno di determinare i parametri cinetici e termodinamici dell’interazione, inclusi i valori di associazione, dissociazione e affinità. Il candidato si occuperà dell’ottimizzazione dell’immobilizzazione delle proteine e delle condizioni sperimentali per le misure SPR. I dati sperimentali ottenuti mediante NMR e SPR saranno integrati con simulazioni atomistiche di dinamica molecolare. Saranno preparati modelli strutturali delle singole proteine e del complesso OSCP–ciclofillina D. Le simulazioni permetteranno di valutare la stabilità, la flessibilità e le principali variazioni conformazionali del complesso. L’analisi delle traiettorie consentirà di individuare residui chiave, contatti intermolecolari e reti di interazione persistenti. Il confronto con i dati NMR e SPR permetterà di validare e affinare i modelli molecolari ottenuti dalle simulazioni. L’obiettivo finale sarà definire le basi strutturali, dinamiche e cinetiche dell’interazione tra OSCP e ciclofillina D. Descrizione delle attività di collaborazione alle attività di terza missione su cui il titolare di incarico post-doc verrà impegnato: Collaborazione alla progettazione e all’attuazione di iniziative di comunicazione scientifica e disseminazione dei dati, al fine di diffondere i risultati della ricerca presso un pubblico accademico e non. Direzione Risorse Umane e Affari Generali Ufficio Personale Accademico Responsabile della Direzione pro tempore: Gabriele Rizzetto Responsabile dell’Ufficio Personale Accademico: Silvia De Liddo Compilatore del procedimento: Michela Finelli
Documento informatico firmato digitalmente ai sensi del D.Igs. 82/2005 s.m.i. e norme collegate, il quale sostituisce il documento cartaceo e la firma autografa
Decreto Rettorale
Descrizione dell’attività di collaborazione alle attività didattiche (integrative e di servizio agli studenti): Supporto alle attività di laboratorio di studenti e dottorandi coerenti con le attività scientifiche del progetto. Profilo del ricercatore da assumere con indicazione delle conoscenze e competenze richieste ai fini dello svolgimento delle attività richieste: -Espressione di proteine ricombinati marcate al 2H, 13C, 15N -Conoscenze teorico-pratiche della spettroscopia di risonanza magnetica nucleare applicata alle proteine -Conoscenza ed esperienza nella realizzazione ed analisi di simulazioni di dinamica molecolare. Impegno lavorativo richiesto in relazione alle attività e gli obiettivi assegnati: 1500 ore Articolazione mensile della prestazione (Timing) legata alle esigenze del progetto: 5 giorni da lunedì a venerdì e comunque in base alle esigenze di orario delle attività del laboratorio. Responsabile scientifico del progetto di ricerca: Prof. Alessandra Corazza, professore ordinario presso l’Università degli Studi di Udine, gruppo scientifico disciplinare 02/PHYS-06 - FISICA PER LE SCIENZE DELLA VITA, L'AMBIENTE E I BENI CULTURALI, DIDATTICA E STORIA DELLA FISICA, settore scientifico disciplinare PHYS-06/A - FISICA PER LE SCIENZE DELLA VITA, L'AMBIENTE E I BENI CULTURALI. Struttura sede principale di svolgimento delle attività di ricerca: le attività saranno svolte prevalentemente presso il Dipartimento di Medicina dell’Università degli Studi di Udine. Il ricercatore potrà eventualmente svolgere parte delle attività presso altre istituzioni, in base alle specifiche esigenze del programma. Numero massimo di pubblicazioni che i candidati possono presentare: 5 Lingua straniera di cui verrà accertata la conoscenza nel corso del colloquio: inglese Il candidato straniero deve inoltre dimostrare l’adeguata conoscenza della lingua italiana Tutti gli atti rilevanti per la procedura saranno pubblicati all’albo on-line dell’Ateneo e avranno valore di notifica a tutti gli effetti. Articolo 2 Requisiti di ammissione Alla selezione possono partecipare i candidati, anche cittadini di Paesi non appartenenti alla Unione Europea, in possesso, alla data di scadenza del termine utile per la presentazione delle domande di ammissione, del dottorato di ricerca o titolo equivalente conseguito in Italia o all’estero. Nel caso di titolo di dottorato conseguito all’estero, saranno ammessi i titoli accademici conseguiti all’estero dichiarati dall’autorità italiana equivalenti o equiparati ai titoli richiesti, secondo la normativa vigente. Direzione Risorse Umane e Affari Generali Ufficio Personale Accademico Responsabile della Direzione pro tempore: Gabriele Rizzetto Responsabile dell’Ufficio Personale Accademico: Silvia De Liddo Compilatore del procedimento: Michela Finelli
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Decreto Rettorale
Estratto del bando; il testo completo è nei documenti ufficiali qui sotto.
Dati della procedura
- Ente: University of Udine
- Struttura: Dipartimento di Medicina Gruppo scientifico disciplinare
- Settore: 02/PHYS-06
- Tipologia: Incarichi post-doc
- Codice bando: 2026IPD50_02PHYS06_DMED
- Apertura domande: 05-10-2026 00:00
- Scadenza domande: 20-10-2026 13:00
University of Udine
Udine, Italy